但因網拍一族則可區分成企業與個人兩種，財政部對企業與個人網拍族，也必須採取不同的課稅管理。網拍族涉及的稅捐不少，根據財政部陸續發布有關網拍族的課稅法令，在網路上販售商品或勞務，個人或企業通常要面對的稅捐包括了營業稅、所得稅、房屋稅與地價稅。
一、網拍與營業稅
網拍要課營業稅，也是基於虛擬商店應與實體商店課稅一致化的觀念而來。以美國為例，除聯邦政府對於以營利為目的的網路商店課稅外，同時也有18個州對網路交易課徵銷售稅（包括營業稅）。
台灣的財政部因此根據現行「加值型及非加值型營業稅法」（簡稱營業稅）第1條規定，在我國境內銷售貨物或勞務均應依法課稅；以及同法第6條第1款規定，以營利為目的的公營、私營或公私合營的事業即稱為「營業人」的這兩項規定，明令網路拍賣的賣家如以營利為目的，採進、銷貨方式經營，透過網路銷售貨物或勞務者，就要繳納營業稅。
很重要的一個觀念在於財政部規定網路拍賣要課營業稅，前提必須要有「營利行為」，採進、銷貨方式經營並透過網路銷售。因此可以反過來這樣說，如果網拍族賣家透過網路出售的是自己使用的二手商品、或買來卻未使用、或受贈禮物但不適用的商品，可以不必因在網路上販售的行為而繳稅。
譬如，在網路上出售數位相機、自用汽車或服飾、家具，只要網路賣家並非職業賣家，沒有不斷進貨、銷貨紀錄，就算符合財政部所訂出售「自用、家用物品或二手物品」範圍，不必課稅。
但是，拍賣二手商品免稅，並非所有前手用過的東西，拿到網路上去賣就都免稅。網拍族還是要注意不能涉及進、銷貨行為。說明白一點，如果有網拍賣家透過管道蒐購二手商品，然後再在網上賣掉牟利，同樣是二手商品，因為是蒐購而得再出售，就要算是有營利行為，不能免稅了。
還有一點要注意，網路商店最大的商機就是無國界，網路賣家在中華民國境內，透過拍賣網站的平台銷售貨物，符合有營利行為就要繳稅。當網路賣家在國外，出售貨物給中華民國消費者時，國外賣家將貨物自國外寄送到台灣，基於我國營業稅採取屬地主義（即採消費地或銷售地課稅原則），當貨物進到台灣時，海關會代徵一筆營業稅。
二、哪種網拍族要辦營業登記？
實體商店與網路虛擬商店最大的不同，就在於實體商店一定要辦營業登記，但網路商店卻不一定。即使符合「以營利為目的、採進銷方式經營，透過網路銷售貨物或勞務」要件的網拍賣家，也不一定都要辦營業登記（或稅籍登記）。
財政部在規範網路拍賣行為時，曾於2005年5月5日發布「網路交易課徵營業稅及所得稅規範」。依據這個規範，網拍賣家的課稅標準必須比照實體商店。因此，目前一般營業人每月銷售貨物營業額未達6萬元（勞務未達3萬元），可以不必課徵營業稅。網拍賣家也一樣，透過網路每月交易額未達6萬元，也可以不必向國稅局辦理稅籍登記。不過，一旦網拍族的月營業額超過6萬元，就要向國稅局辦理稅籍登記並繳稅。
「營業登記」（或稅籍登記）與「營利事業登記」是不同的。依據「營業稅法」第28條規定，營業人的總機構及其他固定營業場所，應在開始營業前，分別向主管機關（國稅局）申請營業登記。因此，財政部要求需要辦理營業登記的網拍賣家辦理營業登記或稅籍登記，並不是指營利事業登記。
須辦理稅籍登記的網拍賣家，前提當然是在網站上有營利行為，且每月貨物銷售額達到6萬元（銷售勞務則為3萬元）。要辦稅籍登記的網拍賣家應準備以下資料：
1. 檢附網路賣家的國民身分證及印章，由納稅人（網拍賣家）自行選擇向住（居）所或戶籍所在地的財政部各地區國稅局所屬分局、稽徵所辦理。
2. 申辦稅籍登記時，要填寫「營業登記（設立）登記申請書（其他類）」書表。
3. 營利事業名稱欄：應填寫網路拍賣賣家的個人姓名。如果網拍賣家已在網路上設有商號名稱時，可以自行選擇填寫商號名稱，但填寫商號名稱者須再附上營利事業印章，即所謂的「大章」。
4. 營利事業地址欄：應填寫網拍賣家所選擇的住（居）所或戶籍地址（可免附房屋稅稅單或租賃契約影本），作為國稅局送達稅單之用。因此，地址欄一定要明確，以免日後稅單沒有送達形成欠稅。
很重要的一件事，營利事業所在地房屋稅籍編號欄的資料，並不需要填寫。網拍賣家所填載的營利事業地址，並不代表就會被稅捐機關認定為該址就有營利行為，影響其址適用房屋稅或地價稅的權利。例如，以住家為營業地址欄居所者，稅捐機關不會認定住家就是營業場所，據予取消住家的低稅率房屋稅或地價稅。
5. 營業項目：應填寫「網路購物」並註明拍賣網站網址及會員編號，但是千萬不要填上個人密碼。個人在網站上申請的拍賣密碼與課稅無關，網拍賣家甚至也不必將個人密碼告訴國稅局人員。
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